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PLATFORM INTRODUCTION
平臺(tái)介紹
科研合作
平臺(tái)介紹
末端修飾-單堿基延伸法TM-SBE:當(dāng)所需檢測(cè)的DNA濃度極低時(shí)(例如cffDNA和CTC),可用生物素標(biāo)記的ddNTP作SBE的底物,成功延伸的片段可以被avidin耦聯(lián)的磁珠吸附,從而富集,達(dá)到所需的檢測(cè)濃度。
技術(shù)原理
質(zhì)譜:試樣中的組分在離子源中發(fā)生電離,形成不同荷質(zhì)比的帶電離子,經(jīng)加速電場(chǎng)作用形成離子束,先后轟擊在檢測(cè)器,并經(jīng)電腦收集計(jì)算得到對(duì)應(yīng)譜圖。
核酸質(zhì)譜的技術(shù)優(yōu)勢(shì)
基于SBE和MALDI-TOF MS搭建的massarray核酸質(zhì)譜系統(tǒng),在樣本選擇、實(shí)驗(yàn)耗時(shí)、花費(fèi)、結(jié)果準(zhǔn)確性和可重復(fù)性等方面,均有很大的優(yōu)勢(shì) 。
1、高靈活性和可擴(kuò)展性
可選購(gòu)預(yù)裝的檢測(cè)panel,也可以自行通過agena網(wǎng)站的ADS線上程序設(shè)計(jì)多重引物組合,最高40重。有24、96、384孔可供選擇。
2、適用多種樣本,靈敏度和準(zhǔn)確度高
一輪擴(kuò)增子長(zhǎng)度80-120bp,起始DNA量可低至5pg,cfDNA、FFPE等低溶度、片段化的模板均適用。SBE和質(zhì)譜技術(shù)的結(jié)合,使檢測(cè)結(jié)果可信度顯著上升
3、時(shí)間成本和經(jīng)濟(jì)成本低
所用引物無需特殊標(biāo)記,操作過程同板同孔,中間無轉(zhuǎn)板和純化步驟,自動(dòng)化程度高,手動(dòng)操作時(shí)間短,8小時(shí)即可完成最多2快384孔板的檢測(cè)
4、結(jié)果自動(dòng)分析,實(shí)驗(yàn)可重復(fù)性高
系統(tǒng)自帶的Typer軟件,能夠自動(dòng)解析譜圖,給出完善的分析結(jié)果。相較熒光PCR,質(zhì)譜通過讀取核酸的分子量,從而提供一種更加準(zhǔn)確、重復(fù)性高的試驗(yàn)方法
應(yīng)用
NGS的完美搭檔:由于MassARRAY系統(tǒng)兼容各種來源和質(zhì)量的DNA樣品,且相比NGS,操作更加簡(jiǎn)便,時(shí)間和經(jīng)濟(jì)花費(fèi)更少,因此,是使用NGS檢測(cè)前,對(duì)核酸樣品進(jìn)行質(zhì)控和鑒定的優(yōu)先選擇。